Job Description
Etsimme postdoc-tutkijaa Suomen Akatemian rahoittamaan hankkeeseen (FUNGAME), jossa tutkitaan männyn sienipatogeeneja.
Työtehtävän kuvaus
Hanke keskittyy kahteen kotelosienilajiin, havuparikas (Diplodia sapinea) ja surmakka (Gremmeniella abietina), joita käytetään mallijärjestelminä patogeenien kasvun, virulenssin ja molekyylaaristen mekanismien tutkimiseen sekä mykovirusten roolin selvittämiseen patogeenien toiminnassa. Laboratoriokokeet toteutetaan kontrolloiduissa olosuhteissa korkealaatuisen aineiston tuottamiseksi, erityisesti sienipatogeenien ominaisuuksien karakterisointiin keskittyen.
Työ sisältää kontrolloitujen inokulaatiokokeiden (itiöitä käyttäen) suunnittelua ja toteutusta, DNA-eristyksiä sekä sekvensointiaineiston (High-throughput sequencing, ITS2) analysointia. Tehtäviin kuuluu myös havuparikkaan genomin annotointi, RNA-eristyksiä männyn versoista sekä transkriptomiikan analyysejä. Lisäksi tehtävään kuuluu osallistuminen mykovirustutkimukseen, m...